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Il Servizio svolge attività istruttoria precedente e successiva alle sedute della Conferenza Stato-Regioni e della Conferenza Unificata, attraverso il necessario raccordo con i competenti uffici di Stato, Regioni, Province autonome e Enti locali, per l'esercizio delle funzioni nelle seguenti materie:
- Funzionamento del mercato e dello sviluppo rurale, quali componenti della politica comune dell’agricoltura (PAC);
- gestione dei fondi comunitari;
- pesca e acquacoltura, compresi i prodotti ittici;
- certificazione di qualità dei prodotti alimentari e le frodi;
- caccia, attività venatoria e la determinazione delle specie cacciabili ex art.18, co. 3, L.157/92;
- grandi reti di irrigazione;
- ippica;
- eccezionali avversità atmosferiche;
- programmazione agrituristica;
- salvaguardia e tutela dei patrimoni genetici delle specie animali e vegetali;
- regolazione del settore fitosanitario, dei fertilizzanti e delle sementi nonché il materiale di propagazione;
- tutela e valorizzazione delle foreste e della loro biodiversità, nell'ambito degli obiettivi green dell'Unione Europea;
- controllo del consumo di suolo forestale, con la gestione degli interventi di protezione;
- tutela e valorizzazione dei prodotti forestali e del sottobosco;
- elaborazione e politica della filiera del legno, in coerenza con gli impegni governativi assunti in sede europea;
- sviluppo economia montana;
- statistica e rapporti con il Sistan;
- protezione civile (prevenzione del rischio sismico, vulcanico, idraulico, soccorso e assistenza delle popolazioni colpite da calamità, classificazione sismica) - SOUP (Sale operative unificate permanenti);
- acquisizione di designazioni in organismi ed enti correlati alle attività del servizio.
Il Servizio partecipa, inoltre, con propri rappresentanti, ai seguenti tavoli tecnici e gruppi di lavoro:
- Tavolo permanente sui danni da animali selvatici, istituito in Conferenza Unificata con Atto Rep. n.27/CU dell'11 febbraio 2016;
- Comitato tecnico in agricoltura, a carattere tecnico-politico, istituito presso la Segreteria della Conferenza Stato-Regioni con Atto Rep. n.380 dell'11 dicembre 1997;
- Comitato paritetico ISTAT-Regioni in materia statistica;
- Gruppo permanente di lavoro ISTAT, Regioni, Enti locali in materia di statistica.
Infine, il Servizio cura i rapporti con il Dipartimento Affari Giuridici e Legislativi, con l'Avvocatura dello Stato e con i Tribunali Amministrativi regionali per l'istruttoria dei ricorsi nelle materie di competenza. Fornisce elementi per gli atti di sindacato ispettivo ed informazioni ad associazioni, privati cittadini, istituzioni private in materie riguardanti il servizio.